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问号钩端螺旋体基因组DNA芯片的研制
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| 盛跃颖2; 史耀舟3; 何平1; 杨杨1; 胡宝瑜1; 赵国屏3; 郭晓奎1 |
1上海市疾病预防控制中心，上海 200025
2上海生物芯片公司;
3 上海交通大学医学院病原生物学教研室 |
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| Construction and validation of Leptospira interrogans genome DNA microarray |
| SHENG Yue-ying2; SHI Yao-zhou3; HE Ping1; YANG Yang1; HU Bao-yu1; ZHAO Guo-pin3; GUO Xiao-kui1 |
Department of School of Medicine Microbiology and Parasitology, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai 200025, China |
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摘要: 目的 研制并初步评估问号钩端螺旋体(简称钩体)赖型赖株的基因组DNA芯片。方法 利用Primegens引物设计软件筛选出问号钩体赖型赖株全基因组中的特异性基因进行引物设计。对成功设计出相应引物的3 290个基因用聚合酶链反应方法进行扩增,以纯化后的产物点样制备芯片。并用双色荧光杂交策略对芯片质量进行了初步平估。结果 共获得3 290个基因产物用于点样。参考株自身杂交实验结果表明:该芯片有较高的点一致性、信噪比和较低的假阳性率。结论 成功制备了包含问号钩体赖型赖株3 290个目的基因的基因组DNA芯片,并可用于基于该芯片的问号钩体比较基因组学的研究。
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| 关键词 ：
基因组DNA芯片
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| Key words：
Leptospira interrogans
genome DNA microarray
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| 引用本文: |
盛跃颖2 ; 史耀舟3 ; 何平1 ; 杨杨1 ; 胡宝瑜1 ; 赵国屏3 ; 郭晓奎1 . 问号钩端螺旋体基因组DNA芯片的研制
[J]. 微生物与感染
, 2006, 1(2): 103-104 .
SHENG Yue-ying2; SHI Yao-zhou3; HE Ping1; YANG Yang1; HU Bao-yu1; ZHAO Guo-pin3; GUO Xiao-kui1 . Construction and validation of Leptospira interrogans genome DNA microarray. Journal of Microbes and Infections, 2006, 1(2): 103-104 .
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| 链接本文: |
| http://jmi.fudan.edu.cn/CN/ 或 http://jmi.fudan.edu.cn/CN/Y2006/V1/I2/103 |
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