论著
孙炳欣 李月婷 武艳立 宋亚男 朱静鸿 谭盈盈 张乃千
微生物与感染.
摘要:本研究旨在了解沙门菌分子特征,揭示其菌株间的亲缘关系,为沙门菌暴发溯源提供一定的依据。利用全基因组测序和生物信息学分析技术,筛选长春市近年来105株沙门菌的毒力基因与耐药基因,并对其进行全基因组单核苷酸多态性(whole genome single nucleotide polymorphism, wgSNP)分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)分型和全基因组多位点序列分型(complete genome multilocus sequence typing, cgMLST)分型。本研究分析了144个毒力基因,结果显示沙门氏菌毒力岛(Salmonella pathogenicity island, SPI)基因相对稳定,分泌系统外毒力因子随细菌血清型的不同,携带率相差较大;共筛选10 类69种耐药基因,氨基糖苷类(100%)、β-内酰胺酶类(73.33%)、磺胺类(72.38%)耐药基因携带率较高,大环内酯类(6.67%),林可酰胺类耐药基因(0.95%)携带率较低。105株沙门菌的cgST型别和MLST型别完全相同,分为13种,主要流行株肠炎沙门菌(ST11)和沙门菌I 4,[5],12:i:-(ST34)与国际流行株基本位于同一分支。本研究证实了长春市沙门菌携带较稳定的毒力基因及多重耐药基因,主要流行株在不同时间、来源中均有分布,二者分子特征与国外流行株一致,血清型与ST型、cgST型别密切相关。