2020, Vol. 15
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)属于黄病毒科，其基因组为单股正链线性RNA[1]。人体被HCV感染后可罹患慢性肝炎和肝硬化，最终发展成肝细胞肝癌，甚至死亡[2]。目前的研究认为，HCV编码的蛋白前体经宿主细胞及病毒自身的蛋白酶切割后，产生结构蛋白和非结构蛋白，其中非结构蛋白主要参与病毒翻译复制过程[3]。支持HCV高水平复制的细胞株只有Huh 7.5，它是由α-干扰素(IFN-α)以100 IU/ml的浓度处理HCV复制子细胞后获得。研究人员发现该HCV cured细胞支持HCV高水平复制，但并非所有HCV cured细胞株皆有对病毒易感的新特征[4]。虽然对HCV的探索已有突破性进展，但病毒翻译复制等关键生活周期环节并未彻底研究清楚。细胞模型的缺乏制约了对HCV生活周期进行深入研究，因此构建支持病毒高水平复制的细胞模型将为深入开展HCV基础性科学研究提供有力的工具。
1 材料和方法 1.1 材料肝癌细胞系Huh 7为本室保存[5]。肝癌细胞系Huh 7.5和HCV全长基因组质粒Jc1G为美国洛克菲勒大学Charles Rice教授馈赠[6]。HCV亚基因组sg-Jc1为本室人员在Jc1G基础上构建[5]。试剂：DMEM(Dulbecco’s modified eagle medium)培养基(美国Corning Cellgro公司, 10-013-CVa)，胎牛血清(以色列Biological Industries公司, 04-001-1ACS)，杀稻瘟菌素(美国Invitrogen公司，R21001)，体外转录试剂盒(美国Invitrogen公司，AM1334)，海肾荧光素酶检测试剂盒(美国Promega公司, E2820)，IFN-γ(美国Proteintech公司, HZ-1301)，IFN-α(美国PBLassay science公司, 11200-2)，ECL化学发光试剂盒(美国PerkinElmer公司, NEL103E001EA)，TRIzolTM Reagent (美国Invitrogen公司, 15596018)，反转录试剂盒(日本Takara公司，DRR047A)，荧光定量PCR试剂盒(日本Takara公司，DRR041A)。实验中所用抗体及来源如下：NS3抗体(美国Virogen公司; 217-A)，HRP羊抗鼠二抗(美国Santa Cruz公司; sc-2005)，β-actin抗体(美国Sigma公司; A1978)，MDA5抗体(美国CST公司; 5321S)，RIG-I抗体(美国Enzo Life Sciences公司; Alme1)，MAVS抗体(美国Santa Cruz公司; sc-166583)。
1.2 方法 1.2.1 HCV复制子细胞株的建立将HCV亚基因组sg-Jc1酶切线性化后体外转录的RNA电转入Huh 7细胞，3 d后换含有5 μg/mL的杀稻瘟菌素(blasticidin)培养液置5% CO2、37 ℃培养。此后每隔2 d换液继续培养至细胞单克隆出现。取5~6个克隆，分别种于96孔板中继续置37 ℃培养，培养液中blasticidin的浓度调节为0.5 μg/mL。待细胞在板上长满后，转至更大孔径培养板中, 长满后再转至细胞培养瓶中继续置5% CO2、37 ℃培养，传代扩增细胞并冻存于液氮罐。
1.2.2 HCV cured细胞株的建立将HCV亚基因组复制子细胞株以5×104细胞/mL铺于T25细胞培养瓶，置5% CO2、37 ℃培养过夜。次日更换含有1 000 IU/瓶IFN-γ的新鲜培养基，每隔2 d换液1次，待培养瓶内细胞长满后进行传代，培养3周。3周后撤去IFN，继续培养细胞1周后，取细胞样本检测病毒RNA，阴性细胞进行传代扩增并冻存于液氮罐。
1.2.3 病毒感染将细胞以5×104孔铺板于48孔板，待细胞汇合度为30%~40%时加入病毒Jc1-G[感染复数(multiplicity of infection, MOI)为0.1]。感染后6 h用磷酸盐缓冲液(phosphate buffered saline, PBS)洗3遍，更换新鲜培养基，48 h后收集细胞上清液和细胞。
1.2.4 荧光素酶活性检测开启荧光检测仪GloMax® 20/20 Luminometer(美国Promega公司)，将机器参数设置为Read 10 s; delay 2 s。取上清液10 μL，加入10 μL 2×passive lysis buffer混匀后加入50 μL 1× renilla luciferase substrate，吹吸5次后插入仪器样品槽读取荧光数值。
1.2.5 蛋白质印迹检测取细胞蛋白样品进行丙烯酰胺凝胶电泳(10%分离胶)，电转印至硝酸纤维素膜上，用含有5%脱脂奶粉和0.05%吐温的PBS置室温封闭1 h，分别加NS3抗体和β-actin抗体置4 ℃孵育过夜，次日加HRP羊抗鼠二抗置室温孵育2 h后，用ECL化学发光检测。
1.2.6 荧光定量PCRTRIzol裂解细胞后加入氯仿混匀，12 800 g离心15 min，取上清液加入等量的异丙醇(isopropyl alcohol)，温和地上下颠倒数次，12 800 g离心15 min。用预冷的75%乙醇洗涤沉淀物后加入焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶解。取1 μg RNA按照反转录试剂盒试剂盒操作步骤进行反转录。取反转录产物参照荧光定量PCR试剂盒试剂盒说明书进行荧光定量PCR。定量引物见表 1。
| Primer | Sequence (5′-3′) | Use |
| HCV | CCCTGTGAGGAACTACTGTCTTCACGC | The forward primer for HCV specific 5UTR |
| HCV | GCTCATGGTGCACGGTCTACGAGA | The reverse primer for HCV specific 5UTR |
| GAPDH | GGTATCGTGGAAGGACTCATGA | The forward primer for GAPDH specific gene |
| GAPDH | ATGCCAGTGGCTTCCCGTTCAGC | The reverse primer for GAPDH specific gene |
| MDA5 | CGTATAGGTGTTGGCTCTATGC | The forward primer for MDA5 specific gene |
| MDA5 | TGGGCAACTTCCATTTGGTAAG | The reverse primer for MDA5 specific gene |
| RIG-I | CCTACCTACATCCTGAGCTACAT | The forward primer for RIG-I specific gene |
| RIG-I | TCTAGGGCATCCAAAAAGCCA | The reverse primer for RIG-I specific gene |
| MAVS | ATAAGTCCGAGGGCACCTTT | The forward primer for MAVS specific gene |
| MAVS | GTGACTACCAGCACCCCTGT | The reverse primer for MAVS specific gene |
| MX1 | CCACTGGACTGACGACTTGA | The forward primer for MX1 specific gene |
| MX1 | GAGGGCTGAAAATCCCTTTC | The reverse primer for MX1 specific gene |
| MX2 | CACCGAGCTAGAGCTTCAGGA | The forward primer for MX2 specific gene |
| MX2 | CCGGGAAGGTCAATGATGGT | The reverse primer for MX2 specific gene |
| ISG56 | TAGCCAACATGTCCTCACAGAC | The forward primer for ISG56 specific gene |
| ISG56 | TCTTCTACCACTGGTTTCATGC | The reverse primer for ISG56 specific gene |
| OAS1 | AAGGCTGGAATTTCATTCTC | The forward primer for OAS1 specific gene |
| OAS1 | CATTTTCAGGTGGGACTCT | The reverse primer for OAS1 specific gene |
| OAS2 | AGGTGGCTCCTATGGACGG | The forward primer for OAS2 specific gene |
| OAS2 | TTTATCGAGGATGTCACGTTGG | The reverse primer for OAS2 specific gene |
| Viperin | CCTGCTTGGTGCCTGAAT | The forward primer for viperin specific gene |
| Viperin | CTACCAATCCAGCTTCAGA | The reverse primer for viperin specific gene |
| CXCL10 | AGGAACCTCCAGTCTCAGCA | The forward primer for CXCL10 specific gene |
| CXCL10 | ATTTTGCTCCCCTCTGGTTT | The reverse primer for CXCL10 specific gene |
| IFITM1 | TCTTCTTGAACTGGTGCTGTC | The forward primer for IFITM1 specific gene |
| IFITM1 | GTCGCGAACCATCTTCCTGT | The reverse primer for IFITM1 specific gene |
| IFITM3 | TCCCAC GTACTCCAACTTCCA | The forward primer for IFITM3 specific gene |
| IFITM3 | AGCACCAGAAACACGTGC ACT | The reverse primer for IFITM3 specific gene |
应用Graphpad Prism 6软件作图并分析数据。组间采用t检验比较差异，P < 0.05表示差异有统计学意义。
2 结果 2.1 HCV cured细胞株Huh 7A和Huh 7B的建立首先建立HCV亚基因组复制子系统。将体外转录的sg-JFH1 RNA电转到Huh 7细胞中，3 d后用5 μg/mL的blasticidin进行克隆筛选。筛选出2株单克隆细胞株，命名为6#和8#。
利用IFN-γ分别处理6#和8#HCV亚基因组复制子细胞，每隔2~3 d用含有IFN-γ培养液传代培养，3周后换不加IFN-γ培养基继续培养1周，将获得的2株细胞株分别命名为Huh 7A和Huh 7B，应用荧光定量PCR检测HCV RNA拷贝数。结果显示，6#和8#细胞株均检测出HCV RNA，提示HCV亚基因组复制子细胞株成功建立; Huh 7、Huh 7A和Huh 7B细胞内未检测出HCV RNA，提示Huh 7A和Huh 7B是HCV cured细胞株(图 1)。
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| Replicon 6# and 8# cells were generated by electroporation of in vitro transcribed sgJc1 RNA into Huh7 cells and selection with blasticidin. The two replicons 6# and 8# cells were treated with interferon gamma and designated as Huh 7A and Huh 7B respectively. HCV RNA levels in indicated cells were quantified by quantitative RT-PCR and normalized against GAPDH RNA levels. Results are reported as mean±s (n=4). 图 1 HCV cured细胞株Huh 7A和Huh 7B的建立 Fig. 1 Generation of highly permissive cell lines for HCV replication |
为验证Huh 7A和Huh 7B细胞株是否支持HCV高水平复制，利用HCV Jc1-G株分别感染Huh 7、Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞，感染72 h后收集上清液和细胞分别进行荧光素酶活性测定、蛋白质印迹和荧光定量PCR检测。结果显示，与Huh 7相比，Huh 7A和Huh 7B细胞上清中Gluc活性水平显著上调(图 2A); Huh 7A和Huh7B细胞内HCV NS3蛋白表达和HCV RNA拷贝数相比较Huh 7亦显著增加，其中HCV RNA水平较Huh 7细胞显著增加，与Huh 7.5细胞内病毒RNA水平接近(图 2B、C)。以上结果提示，所获得的Huh 7A和Huh 7B细胞株与HCV cured细胞株Huh 7.5在HCV易感性方面相似。
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| Huh 7 cells, Huh 7.5 cells, Huh 7A cells and Huh 7B cells were infected with HCV Jc1G at an MOI of 0.1 for 2 days. A: Gaussia luciferase (Gluc) activity in the supernatant from infected cells is shown. Results are reported as mean±s (n=4). ****P < 0.000 1, ****P < 0.000 1, ***P=0.000 1. B: HCV RNA levels in the infected cells were determined by quantitative RT-PCR and normalized against GAPDH RNA levels. Results are reported as mean±s (n=3). *P=0.022 1, ***P=0.000 5, **P=0.001 6. C: Western blot analysis of infected cells with antibodies against the proteins indicated. Representative result from three independent experiments is shown. 图 2 Huh 7A和Huh 7B细胞株支持HCV高水平复制 Fig. 2 Identification of highly permissive cell lines for HCV replication |
为检测Huh 7A和Huh 7B细胞株内源性RIG-I/MDA5/MAVS表达，收集Huh 7、Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞分别进行蛋白质印迹和荧光定量PCR检测。结果显示，与Huh 7细胞相比，Huh 7A和Huh 7B细胞内RIG-I内源性蛋白表达轻微下调，分别降至Huh 7细胞的60%和80%，但mRNA水平差异无统计学意义(P>0.05)，P值分别为0.56和0.14;Huh 7、Huh 7A和Huh 7B细胞内MDA5和MAVS蛋白表达和mRNA水平皆无显著差异(图 3A、B)。Huh 7.5细胞内源性RIG-I表达明显降低，蛋白水平和mRNA水平分别降至Huh 7细胞的21%和52%(P < 0.05)(图 3A、B)。有趣的是，Huh 7.5细胞内源性MDA5表达亦显著下调，蛋白水平几乎检测不到，mRNA水平仅有Huh 7细胞的27%(图 3A、B)。Huh 7.5细胞内源性MAVS蛋白和mRNA水平轻微上调，但差异无统计学意义(P=0.32)，见图 3A、B。
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| A: Western blotting analysis of the endogenous protein expression in Huh 7 cells, Huh 7.5 cells, Huh 7A cells and Huh 7B cells with the indicated antibodies. Gel analysis of proteins in panel A with Image J software. B: Real-time PCR quantification of endogenous RIG-I, MDA5, MAVS mRNA levels in indicated cells. The mRNA levels fold induction was normalized to the Huh 7 group. Results are reported as mean±s (n=4). **P=0.001 4, ***P=0.000 3. Similar results were observed in another independent experiment. 图 3 Huh 7A和Huh 7B细胞株RIG-I/MDA5/MAVS内源性表达 Fig. 3 Comparisons of RIG-I/MDA5-mediated signaling pathway between Huh 7 cells and highly permissive cell lines derived from Huh 7 cells |
为验证Huh 7A和Huh 7B细胞株中抗病毒效应ISGs表达是否异常，利用IFN-α分别处理Huh 7、Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞，应用荧光定量PCR检测ISGs表达。结果显示，Huh 7A和Huh 7B细胞株isg56，mx1，mx2，oax1，oax2，viperin，cxcl10，ifitm1和ifitm3表达变化与Huh 7细胞株趋势一致，其mRNA水平与Huh 7细胞的相比皆无显著差异; 与Huh 7、Huh 7A和Huh 7B细胞株相比，Huh 7.5 ISGs表达变化和水平亦无明显差异(图 4A)。
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| A: Huh 7, Huh 7.5, Huh 7A and Huh 7B cells were seeded and untreated or treated with 500 IU/ml of interferon-alpha for 6 hours respectively. The indicated ISGs mRNA levels were quantified by quantitative PCR and normalized against GAPDH RNA levels. The mRNA level fold induction was normalized to the IFN-untreated groups. Results are reported as mean±s (n=4). Similar results were observed in another independent experiment. B: Huh 7, Huh 7.5, Huh 7A and Huh 7B cells were seeded and treated with 0, 10, 50, 100 and 500 IU/ml of interferon-alpha respectively. Following incubation for 6 hours, the indicated mx1 mRNA levels were quantified and normalized against GAPDH RNA levels. The mRNA level fold induction was normalized to the 0 IU/ml of IFN groups. Results are reported as mean±s (n=4). Representative data from multiple experiments with similar results are shown. 图 4 Huh 7A和Huh 7B细胞株ISGs表达 Fig. 4 Comparisons of ISG production by IFN-α between Huh 7 cells and highly permissive cell lines derived from Huh 7 cells |
为进一步验证ISGs mx1表达水平是否异常，利用不同浓度IFN-α分别处理Huh 7、Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞，应用荧光定量PCR检测mx1表达。结果显示，10 U/mL IFN-α即可提高细胞内mx1 mRNA水平，且随着IFN-α浓度的增加，mx1表达水平显著上调; 但这种变化在4种细胞之间皆无显著差异，提示Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞株对HCV易感可能与mx1无关(图 4B)。
3 讨论目前HCV仍然是严重危害人类健康的重要病原体之一[1]。近年来，一些靶向HCV蛋白的药物(direct-acting antiviral agent, DAA)被批准上市，具有抗病毒效果好、副作用小的优点，但药物费用高昂，且部分患者治疗效果不佳[7]。虽然针对HCV的治疗已经取得重大进展，但病毒的生活周期等重要环节尚未研究透彻，还需深入探讨。Blight等发现HCV复制子细胞经过IFN-α处理后显示出对病毒易感的特性，将其命名为Huh 7.5[4]，该细胞株是目前唯一公认支持HCV高复制水平的细胞株。为构建支持HCV高复制水平的细胞株，本研究采取IFN-γ治疗HCV复制子细胞策略，分别处理单克隆复制子细胞株6#和8#，筛选出2株细胞株(Huh 7A和Huh 7B)。实验结果显示，在Huh 7A和Huh 7B细胞株中，病毒基因组中插入的Gluc报告基因活性和病毒RNA复制水平明显上调，病毒蛋白的表达亦显著增加，接近Huh 7.5的病毒复制水平，表明Huh 7A和Huh 7B细胞株可支持病毒高水平复制。虽然不同的单克隆复制子细胞株中病毒复制水平存在差别，但本研究获得的2株HCV cured细胞株Huh 7A和Huh 7B对HCV易感性并无显著差异，提示HCV cured细胞株易感机制可能与宿主细胞因素相关。
有文献报道RIG-I/MDA5/MAVS通路通过识别HCV双链RNA后诱导产生IFN从而抑制病毒复制[8]。已有研究发现Huh 7.5细胞内RIG-I突变，但在Huh 7细胞中敲除该基因后并不能增加病毒复制水平，提示Huh 7.5细胞对HCV易感可能与RIG-I突变不相关[9]。本研究检测Huh 7、Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞中RIG-I/MDA5/MAVS蛋白和mRNA水平，发现Huh 7.5细胞表达RIG-I显著下调; 有意思的是MDA5表达亦明显降低，但这是否与Huh 7.5细胞对HCV易感相关还需进一步验证。而Huh 7A和Huh 7B细胞中RIG-I/MDA5/MAVS表达水平与Huh 7细胞无显著差异，说明Huh 7A和Huh 7B细胞对HCV易感可能与RIG-I/MDA5/MAVS通路无关，或许存在其他机制。
抗病毒ISGs mx1被报道可能与HCV cured细胞易感性相关，有报道发现用IFN-α刺激HCV cured细胞，抗病毒基因mx1激活倍数显著减少，敲除该基因后病毒复制水平增加，而回补该基因则抑制病毒复制[10]。本研究用IFN-α处理4种细胞并检测已报道的具有抗病毒效应的ISGs激活水平，发现无论在Huh 7.5细胞还是在Huh 7A和Huh 7B细胞中，ISGs的激活水平均与Huh 7细胞中的一致。为进一步验证mx1与Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞HCV易感相关性，用不同浓度的IFN-α处理细胞，发现4种细胞中mx1激活水平随着IFN剂量增加而增加，激活倍数无显著差异，说明不同株的HCV cured细胞其易感性机制不同。
综上所述，对HCV cured细胞易感性虽有不少研究，但具体机制尚存在争议。下一步我们将在Huh 7.5、Huh 7A和Huh 7B细胞株中继续探索易感机制，为建立更好的细胞模型提供理论基础，从而为病毒学基础研究提供有力工具。
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