微生物与感染
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微生物与感染
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乙型肝炎病毒聚合酶蛋白多态性的生物信息学分析及其意义
陈喆1; 朱悦2; 李亦学2; 闻玉梅1

1复旦大学上海医学院医学分子病毒学重点实验室,上海 200032

2上海生物信息技术研究中心

陈喆; 朱悦; 李亦学; 闻玉梅
CHEN Zhe1; ZHU Yue2; LI Yi-xue2 ; WEN Yu-mei1
Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, Fudan University, Shanghai 200032, China
全文: PDF (1143 KB)   HTML (0)
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要: 目的 通过Bio-HBV生物数据库,针对乙型肝炎病毒(HBV)聚合酶蛋白序列进行多态性分析。方法 构建Bio- HBV生物数据库,获得国际基因序列库中所有完整的聚合酶蛋白并进行比对,采用信息熵评价序列位点的保守性,结合BLOSUM 90评分系统和PAML方法,寻找选择压力下的理化性质异常的氨基酸替换模式。结果 rt266-271内频发理化性质异常的氨基酸替换,并且具有高度的统计学意义。此外,还用生物信息学的方法分析了聚合酶蛋白的TP、RT和RH功能域的保守性。结论 用生物信息学验证了功能域内已知生物学特性位点的保守性,还从结构生物学出发,推测潜在的功能位点及其意义。
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陈喆1
朱悦2
李亦学2
闻玉梅1
关键词 聚合酶蛋白 多态性分析 TP域 Spacer域 RT域 RH域    
Key wordsB virus    Polymerase protein    Polymorphism    TP domain    Spacer domain    RT domain    RH domain
引用本文:   
陈喆1 ; 朱悦2 ; 李亦学2 ; 闻玉梅1 . 乙型肝炎病毒聚合酶蛋白多态性的生物信息学分析及其意义
[J]. 微生物与感染 , 2006, 1(2): 67-75 .
CHEN Zhe1; ZHU Yue2; LI Yi-xue2 ; WEN Yu-mei1 . 陈喆; 朱悦; 李亦学; 闻玉梅. Journal of Microbes and Infections, 2006, 1(2): 67-75 .
链接本文:  
http://jmi.fudan.edu.cn/CN/      或     http://jmi.fudan.edu.cn/CN/Y2006/V1/I2/67

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