乙型肝炎病毒聚合酶蛋白多态性的生物信息学分析及其意义

陈喆1 ; 朱悦2 ; 李亦学2 ; 闻玉梅1

微生物与感染 ›› 2006, Vol. 1 ›› Issue (2) : 67-75.

PDF(1143 KB)
欢迎访问《微生物与感染》官方网站,今天是
PDF(1143 KB)
微生物与感染 ›› 2006, Vol. 1 ›› Issue (2) : 67-75.
论著

乙型肝炎病毒聚合酶蛋白多态性的生物信息学分析及其意义

  • 陈喆1; 朱悦2; 李亦学2; 闻玉梅1
作者信息 +

陈喆; 朱悦; 李亦学; 闻玉梅

  • CHEN Zhe1; ZHU Yue2; LI Yi-xue2 ; WEN Yu-mei1
Author information +
文章历史 +

摘要

目的 通过Bio-HBV生物数据库,针对乙型肝炎病毒(HBV)聚合酶蛋白序列进行多态性分析。方法 构建Bio- HBV生物数据库,获得国际基因序列库中所有完整的聚合酶蛋白并进行比对,采用信息熵评价序列位点的保守性,结合BLOSUM 90评分系统和PAML方法,寻找选择压力下的理化性质异常的氨基酸替换模式。结果 rt266-271内频发理化性质异常的氨基酸替换,并且具有高度的统计学意义。此外,还用生物信息学的方法分析了聚合酶蛋白的TP、RT和RH功能域的保守性。结论 用生物信息学验证了功能域内已知生物学特性位点的保守性,还从结构生物学出发,推测潜在的功能位点及其意义。

关键词

聚合酶蛋白 / 多态性分析 / TP域 / Spacer域 / RT域 / RH域

Key words

B virus / Polymerase protein / Polymorphism / TP domain / Spacer domain / RT domain / RH domain

引用本文

导出引用
陈喆1 ; 朱悦2 ; 李亦学2 ; 闻玉梅1. 乙型肝炎病毒聚合酶蛋白多态性的生物信息学分析及其意义
[J]. 微生物与感染. 2006, 1(2): 67-75
CHEN Zhe1; ZHU Yue2; LI Yi-xue2 ; WEN Yu-mei1. 陈喆; 朱悦; 李亦学; 闻玉梅[J]. Journal of Microbes and Infections. 2006, 1(2): 67-75

PDF(1143 KB)

Accesses

Citation

Detail

段落导航
相关文章

/