腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析

马绍辉1 ; 张蓉松2 ; 刘龙丁1 ; 王晶晶1 ; 王丽春1 ; 杨文军3 ; 梁燕1 ; 杨子江1 ; 李琦涵1

微生物与感染 ›› 2006, Vol. 1 ›› Issue (2) : 87-90.

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微生物与感染 ›› 2006, Vol. 1 ›› Issue (2) : 87-90.
论著

腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析

  • 马绍辉1; 张蓉松2; 刘龙丁1; 王晶晶1; 王丽春1; 杨文军3; 梁燕1; 杨子江1; 李琦涵1
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Sequence analysis of the SH gene and its flanking region of an isolated of the mumps virus(SP strain)

  • MA Shao-hui1; ZHANG Rong-song2; LIU Long-ding1; WANG Jing-jing1; WANG Li-chun1; YANG Wen-Jun3; LIANG Yan1; YANG Zi-jiang1; LI Qi-hang1
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摘要

目的 比较腮腺炎病毒分离株SP株与其他野毒株的序列差异,以确定其遗传特征。方法 将2005年在云南省石屏县收集到的腮腺炎患儿唾液标本,于Vero细胞培养7 d后观察病变并分离收获病毒,用血细胞吸附试验验证。同时提取病毒RNA,采用反转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法从病毒RNA中扩增出SH基因及其旁侧序列,测序并以VectorNT16.0软件分析。结果 SH基因旁侧区序列分析表明:SP株与国内已知野毒株具有明显的亲缘关系,在SH基因旁侧区范围内的序列一致性为93%~96%,差异均<8%。氨基酸序列分析发现:该毒株与其他国内野毒株在此区域中的氨基酸序列一致性为93.3%~98.25%,与Wlz2株的遗传距离最近。结论 SP株属于F基因亚型。

关键词

SH基因 / 序列分析

Key words

Mumps virus SP strain / Small hydrophobic(SH)gene / Sequence analysis

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马绍辉1 ; 张蓉松2 ; 刘龙丁1 ; 王晶晶1 ; 王丽春1 ; 杨文军3 ; 梁燕1 ; 杨子江1 ; 李琦涵1. 腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析
[J]. 微生物与感染. 2006, 1(2): 87-90
MA Shao-hui1; ZHANG Rong-song2; LIU Long-ding1; WANG Jing-jing1; WANG Li-chun1; YANG Wen-Jun3; LIANG Yan1; YANG Zi-jiang1; LI Qi-hang1. Sequence analysis of the SH gene and its flanking region of an isolated of the mumps virus(SP strain)[J]. Journal of Microbes and Infections. 2006, 1(2): 87-90

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