腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析 <BR>

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摘要: 目的比较腮腺炎病毒分离株SP株与其他野毒株的序列差异,以确定其遗传特征。方法将2005年在云南省石屏县收集到的腮腺炎患儿唾液标本,于Vero细胞培养7 d后观察病变并分离收获病毒,用血细胞吸附试验验证。同时提取病毒RNA,采用反转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法从病毒RNA中扩增出SH基因及其旁侧序列,测序并以VectorNT16．0软件分析。结果 SH基因旁侧区序列分析表明:SP株与国内已知野毒株具有明显的亲缘关系,在SH基因旁侧区范围内的序列一致性为93％～96％,差异均＜8％。氨基酸序列分析发现:该毒株与其他国内野毒株在此区域中的氨基酸序列一致性为93．3％～98．25％,与Wlz2株的遗传距离最近。结论 SP株属于F基因亚型。

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关键词 ： SH基因, 序列分析

Key words： Mumps virus SP strain Small hydrophobic（SH）gene Sequence analysis

引用本文:

马绍辉1 ; 张蓉松2 ; 刘龙丁1 ; 王晶晶1 ; 王丽春1 ; 杨文军3 ; 梁燕1 ; 杨子江1 ; 李琦涵1 . 腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析
[J]. 微生物与感染 , 2006, 1(2): 87-90 .
MA Shao-hui¹; ZHANG Rong-song²; LIU Long-ding¹; WANG Jing-jing¹; WANG Li-chun¹; YANG Wen-Jun³; LIANG Yan¹; YANG Zi-jiang¹; LI Qi-hang¹ . Sequence analysis of the SH gene and its flanking region of an isolated of the mumps virus(SP strain). Journal of Microbes and Infections, 2006, 1(2): 87-90 .

链接本文:

http://jmi.fudan.edu.cn/CN/ 或 http://jmi.fudan.edu.cn/CN/Y2006/V1/I2/87