上海地区部分婴幼儿腹泻标本中诺如病毒基因分析
滕峥; 张曦; 翁康生; 邵俊杰; 赵百慧; 卢伟;
上海市疾病预防控制中心微生物实验室;
Gene sequence analysis of the Norovirus detected in diarrhea samples from infants in a region of Shanghai
TENG Zheng; ZHANG Xi; WENG Kang-sheng; SHAO Jun-jie; ZHAO Bai-hui; LU Wei
Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention; Shanghai 200336; China
摘要: 目的了解2006年上海哨点医院婴幼儿疑似病毒性腹泻散发病例中诺如病毒基因型别和基因特征。方法应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中诺如病毒核酸,测序后使用DNAstar基因分析软件与Genbank中的参考株进行核酸序列分析。结果13份测序结果均属于诺如病毒GⅡ遗传组,以GⅡ.4基因型为主。其中2份核酸序列与2006年德国汉堡毒株序列同源性相近,分别为86.2%和88.2%;2份核酸序列与2006年荷兰乌得勒支毒株序列同源性相近,均为83.9%;其余9份核酸序列与2004年中国广西、2004年和2005年日本东京毒株序列同源性相近,为87.3%～97.5%。结论2006年上海哨点医院婴幼儿疑似病毒性腹泻标本中存在诺如病毒GⅡ.4基因型散发病例,不同病毒株之间差异较大。
关键词 ：
遗传组 ,
基因型 ,
序列分析
Key words ：
Norovirus
Genogroup
Genotype
Sequence analysis
引用本文:
滕峥; 张曦; 翁康生; 邵俊杰; 赵百慧; 卢伟; . 上海地区部分婴幼儿腹泻标本中诺如病毒基因分析 [J]. 微生物与感染
, 2007, 2(3): 148-152 .
Gene sequence analysis of the Norovirus detected in diarrhea samples from infants in a region of Shanghai . Journal of Microbes and Infections, 2007, 2(3): 148-152 .
链接本文:
http://jmi.fudan.edu.cn/CN/ 或 http://jmi.fudan.edu.cn/CN/Y2007/V2/I3/148
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