微生物与感染
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微生物与感染
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腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析
马绍辉1; 张蓉松2; 刘龙丁1; 王晶晶1; 王丽春1; 杨文军3; 梁燕1; 杨子江1; 李琦涵1

1中国医学科学院中国协和医科大学医学生物学研究所病毒免疫室,昆明 650118

2云南省红河洲疾病预防控制中心,蒙自 661100

3石屏县疾病预防控制中心,石屏 662200

Sequence analysis of the SH gene and its flanking region of an isolated of the mumps virus(SP strain)
MA Shao-hui1; ZHANG Rong-song2; LIU Long-ding1; WANG Jing-jing1; WANG Li-chun1; YANG Wen-Jun3; LIANG Yan1; YANG Zi-jiang1; LI Qi-hang1

1Institute of Medical Biology, CAMS & PUMC, Kunming 650118, China;

2Hong He Prefecture Center for Disease Control and Prevention, Mengzi 661100, China

3Shi Ping County Center for Disease Control and Prevention, Shiping 662200, China

全文: PDF (399 KB)   HTML (0)
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要: 目的 比较腮腺炎病毒分离株SP株与其他野毒株的序列差异,以确定其遗传特征。方法 将2005年在云南省石屏县收集到的腮腺炎患儿唾液标本,于Vero细胞培养7 d后观察病变并分离收获病毒,用血细胞吸附试验验证。同时提取病毒RNA,采用反转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法从病毒RNA中扩增出SH基因及其旁侧序列,测序并以VectorNT16.0软件分析。结果 SH基因旁侧区序列分析表明:SP株与国内已知野毒株具有明显的亲缘关系,在SH基因旁侧区范围内的序列一致性为93%~96%,差异均<8%。氨基酸序列分析发现:该毒株与其他国内野毒株在此区域中的氨基酸序列一致性为93.3%~98.25%,与Wlz2株的遗传距离最近。结论 SP株属于F基因亚型。
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关键词 SH基因 序列分析    
Key wordsMumps virus SP strain    Small hydrophobic(SH)gene    Sequence analysis
引用本文:   
马绍辉1 ; 张蓉松2 ; 刘龙丁1 ; 王晶晶1 ; 王丽春1 ; 杨文军3 ; 梁燕1 ; 杨子江1 ; 李琦涵1 . 腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析
[J]. 微生物与感染 , 2006, 1(2): 87-90 .
MA Shao-hui1; ZHANG Rong-song2; LIU Long-ding1; WANG Jing-jing1; WANG Li-chun1; YANG Wen-Jun3; LIANG Yan1; YANG Zi-jiang1; LI Qi-hang1 . Sequence analysis of the SH gene and its flanking region of an isolated of the mumps virus(SP strain). Journal of Microbes and Infections, 2006, 1(2): 87-90 .
链接本文:  
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