ISSN 1673-6184 CN 31-1966/R
本期刊出稿件均为病毒学方面的内容，涉及分子生物学、致病机制、流行病学研究及测序新技术介绍等。其中有关致病机制密切联系临床的研究方式值得倡导。有关病毒第3代基因组测序的技术，对推广新技术有较好的应用价值和前景。本期特别推荐闫章才等撰写的“2007—2016年度国家自然科学基金医学科学领域‘病毒、病毒感染与宿主免疫’项目申请与资助情况分析”一文，对基础与临床研究者均有重要参考价值。该文数据提示历年来国家自然科学基金对“病毒、病毒感染与宿主免疫”领域经费的支持增加，主要资助病毒病原学、病原生物学及其遗传变异规律、病毒致病机制、病毒耐药机制及病毒感染的宿主免疫反应等。病毒结构与功能、病毒复制、病毒遗传变异与进化、病毒与宿主细胞相互作用、新型及复合疫苗研制等是该领域的关键科学问题和研究热点，自然科学基金鼓励就上述科学问题开展具有创新思想的探索研究，同时鼓励开展新发和被忽视的病毒的相关生物医学研究。读者可从中得到结合自身学科发展选择课题的指导。在此特别感谢该文作者的辛勤劳动，能让本刊读者分享这些宝贵资料。本期特约专稿介绍了拉沙热(Lassa fever，LF)研究进展。拉沙热由拉沙热病毒(Lassa fever virus，LFV)引起，是一种通过鼠类传播给人的急性出血性动物源性传染病，病死率高。虽然拉沙热主要在西非地区流行，但在全球多个国家已发现输入性病例。作为“一带一路”的沿线国家，我国临床、公共卫生、病毒学等方面的专家有必要了解这一疾病，从而未雨绸缪 ......
乙型肝炎病毒X蛋白(hepatitis B virus X protein，HBx)全长154个氨基酸，与肝癌发生密切相关。为确定HBx的优势氨基酸序列和热点突变位点，在GenBank中下载所有HBx的氨基酸序列13 950条，剔除插入突变、缺失突变和起始密码子非甲硫氨酸的序列，最后保留7 126条。通过分析这7 126条序列，计算出HBx每个位点的氨基酸分布情况，出现频率最高的氨基酸为该位点的优势氨基酸，其他氨基酸为突变氨基酸。154个位点的优势氨基酸组成HBx优势氨基酸序列。突变率＞10.0%的热点突变位点有32个。其中第36、42、44、87、88和127位氨基酸有4种(突变率＞1.0%)以上突变形式，具有较高的多态性。与肝癌密切相关的K130M/V131I双突变率为34.7%。通过7 126条HBx序列与优势序列的同源性比较，随机选出其中50条序列(2条与优势序列同源性＜75%，48条同源性为76%～99%)，与23条参考序列及优势序列共同构建系统发生树。结果显示，HBx优势氨基酸序列属于基因型C，这与基因型C为全球主要流行型一致。本研究首次系统性分析了GenBank中HBx的优势序列，确定了32个HBx热点突变位点和6个多态性较高的位点，为基于HBx突变的基础和应用研究奠定了基础。
本研究旨在探讨人巨细胞病毒(human cytomegalovirus，HCMV)和内皮细胞特异性分子1(endocan)在胶质瘤发生发展中的作用及机制。利用HCMV感染人脑胶质瘤U87细胞，检测感染后第1、2、4天信号转导及转录激活蛋白 3(signal transducer and activator of transcription 3，STAT3)和endocan的表达变化，并分析HCMV、STAT3和endocan三者之间的可能关联。结果显示，HCMV感染的U87细胞中pSTAT3和endocan表达上调，并随感染时间延长而逐渐升高；用 RNAi干扰STAT3基因表达，endocan表达量下降；利用抗病毒药物更昔洛韦抑制 HCMV 复制后，pSTAT3表达量下降，endocan表达量随之下降。进一步利用免疫组织化学法检测79例脑胶质瘤患者和8例对照者脑组织中pSTAT3表达情况，发现pSTAT3在胶质瘤组织中表达上调；与低级别胶质瘤相比，高级别胶质瘤中pSTAT3染色强度较高。结果提示，HCMV感染可能通过STAT3信号通路上调endocan表达，从而参与胶质瘤的进展。
2013—2014年南京市流感病原监测系统分离到31株流感病毒H3N2亚型毒株，通过提取病毒RNA，反转录-聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction，RT-PCR)扩增血凝素(hemagglutinin，HA)基因片段，进行PCR产物纯化、测序并分析其遗传进化特征。结果显示，31株分离株与疫苗株A/Texas/50/2012之间的核苷酸和氨基酸进化距离分别为0.010 2和0.012 1，核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.9%～99.6%和97.2%～99.3%。遗传进化分析表明，分离株的HA基因分属不同的进化分支，3株2013年分离株属3B基因型，3株2014年分离株属3C.1基因型，2株2014年分离株属3C.2b基因型，其余23株属3C.3a基因型。与疫苗株相比，分离株的分子特征表现为发生N128A/T和P198S/A(去信号肽排列)氨基酸位点变异，均位于抗原决定簇B；分离株抗原决定簇上发生变异的位点共计24个；7株分离株出现126 NWT糖基化位点，3株分离株糖基化位点45NSS和144NNS消失。结果提示， 2013—2014年南京市流感病毒H3N2亚型的HA基因较疫苗株发生了较大变异，疫苗对病毒的预防效果需重新评估。
为了解上海市儿童流行性感冒(简称流感)的流行特征，为儿童流感防控提供实验室依据，本研究按《全国流感监测方案》和《流行性感冒病毒及其实验技术》要求，对上海市某哨点医院2013—2015年采集的流感样患儿标本，采用实时反转录-聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction，RT-PCR)进行核酸检测。共采集咽拭子标本3 359份，检出540份流感病毒阳性，阳性率为16.08%。其中甲型H3流感病毒阳性277例，乙型流感病毒阳性158例，甲型H1N1流感病毒阳性105例。2013—2015年流感病毒检出率依次为10.02%、19.02%和20.81%。阳性率高峰出现在2013年12月—2014年2月(41.77%～64.58%)、2014年7—9月(16.67%～23.29%)、2015年1—3月(35.14%～44.74%)、2015年7—8月(32.65%、40.23%)及2015年12月(41.49%)。1.0岁以下婴儿检出率最低，为7.67%；7.0岁以上最高，为31.83%(148/465)。监测结果显示，流感在冬春季和夏秋季均有一个流行高峰，其中乙型和甲型H1N1流行高峰为冬春季，夏秋季流行高峰主要为甲型H3。引起流感的优势病原亚型在2014年由甲型H3转变为甲型H3/乙型。结果提示，该哨点医院儿童流感的优势病原亚型自2014年开始发生明显改变，应加强对乙型流感等的监测。
随着基因测序技术的创新和应用，新的高通量测序技术不断涌现，以Pacific Biosciences(PacBio)公司的单分子实时测序(single molecule real time sequencing)为代表的第三代测序(third generation sequencing，TGS)技术开始逐渐应用于基因组研究，包括大型基因组拼装、基因结构变异和表观遗传研究等方面。本文主要对TGS技术的原理、特点和应用，特别是在病毒研究中的应用进行介绍，并与第二代测序(next generation sequencing，NGS)技术进行比较，为基因组测序技术的选择及其临床应用提供一定参考。
中华医学会第二十一次全国儿科学术会议于2016年10月20日至23日在广东省珠海市国际会展中心召开。大会邀请了新加坡、美国、英国、意大利、法国、日本、香港、澳门、台湾等10余个国家和地区的40余位著名儿科专家出席会议并做学术讲座。本次大会共收到投稿论文6100多篇，参会人员7000余人，创历年之最。本次大会除全体大会之外，分设呼吸、消化、感染、血液、神经等15个专业学组分会场进行学术交流。感染专业学组共收到稿件230篇，邀请12位专家进行专题讲座，32位代表大会发言，2例疑难病例讨论，400余人参与了感染分会场的学术交流 ......
